随着时间与加工程序的增加，咖啡的寿命就会有所减少；合适的储存方法可以延长咖啡的保鲜期。
适合存储咖啡的地方
咖啡应该储存在干燥、阴凉的地方，一定不要放在冰箱里，以免吸收湿气。咖啡豆和研磨咖啡可以冰冻，唯一需要注重的是，从冷冻柜中拿出咖啡时，需要避免冰冻的部分化开而使袋中咖啡受潮。美国人认为咖啡放在冰箱里比较好。不过时间不会超过一个月。他们从冷冻室取出要喝的咖啡豆分量，趁尚未解冻便开始研磨，煮来饮用。
有助咖啡存储的包装
锡罐可使咖啡香味保留时间较长。塑胶袋也可以，但存放的量比锡罐少。而在国外咖啡豆有时就是放在锡罐或塑胶袋中出售。真空包装更加有利于咖啡的存放，使原有风味更持久。
一旦打开防油或锡箔包装的咖啡袋子，要马上将咖啡豆或咖啡粉放在密封罐里；咖啡粉就不会很快发霉，但和咖啡豆一样会吸收空气中的味道。
咖啡豆的存储
尚未烘焙或炒过的豆子愈沉愈好，咖啡豆一旦被烘焙，就会慢慢失去香味，两星期后香味就荡然无存。因此一次买少量即可，或买少量已经研磨好的咖啡。若邮购咖啡豆专卖店的咖啡，最好买未磨的豆子。
速溶咖啡的存储
即溶咖啡袋是最近加工食品就烘焙和研磨咖啡发展出来的产品，其铝薄材质最大程度的帮助咖啡原有香味的保存。