1、高血压咖啡中含有咖啡因，它能使部分敏感患者血压升高。
2、肾衰竭肾衰竭患者若有高血钾现象，需配合限钾饮食，咖啡含钾量高。
3、消化性溃疡咖啡因刺激胃酸分泌，并使消化系统平滑肌血管松弛，加速食物的代谢，而降低食物的营养价值。
4、糖尿病咖啡因能降低胰脏中胰岛素的分泌，降低葡萄糖的耐受量，增加胰岛素的排泄而使血糖上升。
5、癫痫咖啡因能刺激脑动力中枢，黄口呤会使血管收缩，减少脑部血流量。对癫痫病患者十分不利。
6、心脏病咖啡会增加脂肪及甘油三酯的含量，增加心脏负担及氧气的消耗量。特别是当身体疲倦及吸烟过度时更易引起。
7、缺铁性贫血咖啡会加速食物的代谢而降低铁的吸收率。
8、肾结石预防草酸钙结石复发，须禁食富含草酸的食物，而咖啡即为含草酸丰富的食物。
9、失眠长期饮用咖啡会影响镇静作用，增加清醒次数，使睡眠深度变浅。除以上病患者不能饮用咖啡外，健康的人不一定都适合饮用咖啡，比如孕妇、哺乳期的妇女，运动员等饮用会产生不良感觉或病理现象。