一项对9万日本人所进行的调查表明，与那些从来不喝咖啡的人相比，那些每天喝一杯咖啡的人被诊断患有肝癌的可能性要少23%。而每天喝大量咖啡的人患肝癌的可能性则要少55%。
动物实验也表明，咖啡对肝癌有预防作用。为此，位于东京国家癌症中心的一个研究小组进行了10年的公共健康调查来证明咖啡是否对肝癌有影响。
事实上，喝咖啡的人患肝癌的几率很低，这种发现是全球性的——包括希腊，意大利和日本——这说明“咖啡能抗肝癌”这个发现不是偶然性或地区性的现象。
其他研究发现，咖啡中的咖啡因会刺激饮用者的神经，使其清醒。咖啡因也会加重更年期症状或一些抗生素药物的副作用。过量喝咖啡还会导致流产。但研究也表明，在老鼠身上，带有咖啡因的护肤霜可降低患皮肤癌的危险。
研究者们推断，咖啡能使肝脏酶活跃起来，从而减少肝硬化和肝癌细胞。但是，研究小组并不能确保喝咖啡能预防肝癌。他们指明，有些人因为各种消化疾病或肝脏疾病不适合喝咖啡，这种情况不包括的研究数据之内。
需要提示的是，咖啡中的咖啡因，难融于冷水，却易溶与热水。咖啡因会刺激大脑皮质，消除睡意，增加感觉与思考力以及可作调节心脏机能的强心剂，也有扩张肾脏血管，利尿等作用，然而，含咖啡因成分的，不单只是咖啡。通常一杯咖啡，含咖啡因60-65mg。但摄取过多的咖啡因，容易发生耳鸣心肌亢进(心脏跳动迅速，脉搏次数增加)。及脉搏跳动不均，所以必须适量饮用咖啡。