山葵糊看起来像风行於美国或墨西哥的鳄梨酱；被人恶作剧或因为不了解日本料理的人，有时会一次吃太多山葵，幸好山葵的辣味感比辣椒的辣味感维持较短。山葵可以放在豆腐上吃，或和凉的荞麦面一起食用。小量的山葵也适合放在寿司或生鱼片上。很多时候人们会把山葵跟酱油混合，才让食物蘸上；但是山葵的味道於水中会迅速溶解，吃山葵的最好方法是把食物蘸上酱油後，才加上山葵，并要避免山葵与酱油混合。
山葵通常以根部出售；山葵根需要磨成细泥状才能使用。山葵糊作成後需要封好，防止气味挥发；因此寿司师傅制作寿司时会把山葵放在鱼和饭之间。山葵叶可以食用，也有山葵根的辣味。山葵叶用盐醋酱汁腌制过夜後可制成山葵沙拉，又可以用酱油开水烹煮，作为下饭、下酒的小菜或卷寿司的材料食用，甚至可以蘸上淀粉浆後炸成天妇罗。
化学:山葵的独特味道是由异硫氰酸盐而来的，包括：
6-甲基硫己基异硫氰酸盐
7-甲基硫庚基异硫氰酸盐
8-甲基硫辛基异硫氰酸盐
研究发现异硫氰酸盐能抑制微生物生长。这可能解释了为什么容易变坏的海鲜通常佐以山葵来吃。可是如果对海鲜的品质有怀疑，无论是否佐以山葵都不该进食。山葵并不能治疗食物中毒。
准备方法:山葵通常用金属制的卸铁研磨，但有人爱用较传统的工具，如一面光滑一面粗糙的干鲨鱼皮；也有人亲手制出有齿的磨来准备山葵。不过新鲜的山葵相当昂贵，许多餐馆会宁愿使用粉末状的代替品。